En la actualidad la UEB Mayorista de Medicamentos (UEBMM) de Pinar de Río ha presentado afectaciones en la planificación operativa de las cargas y de sus rutas de transportación. Estas afectaciones se relacionan con el diseño empírico de las rutas de transportación, incidiendo en la prolongación de los ciclos de transportación y en el deterioro de sus indicadores. En este sentido el objetivo general propuesto para el presente estudio fue el de diseñar un sistema de rutas de transportación variables soportado en Sistemas de Información Geográfica. Para ello los métodos y técnicas de investigación empleados fueron el análisis documental, la observación directa y el análisis estadístico. Al mismo tiempo se utilizaron herramientas informáticas para el procesamiento, análisis estadístico y representación de la información de conjunto con la implementación del Sistema de Información Geográfica (SIG) seleccionado. Durante el desarrollo del estudio se escoge al Municipio de Pinar del Río como muestra experimental por la complejidad de su red de distribución y el volumen de carga que sus unidades demandan, preestableciéndose tres variantes de distribución según la tipología de entidades de salud que las conforman, las cuales sirvieron de base para la modelación del sistema. Como resultado de la implementación del SIG ArcGis se determina como variante optima según los indicadores prefijados y las condiciones actuales del proceso, a la alternativa que agrupa a todas las entidades de salud del Casco Urbano de la Cuidad, el Distrito Hermanos Cruz y las unidades de la periferia del municipio Pinar del Río